La Biblioteca prende il nome dalla sua fondatrice, Henriette Hertz, che nel 1912 elargì una donazione di volumi nonchè il Palazzo Zuccari all'ente tedesco Max-Plank Gesellschaft, promotore di scienza e ricerca dal 1910. L'immobile insiste su un'area di forma trapezoidale compresa tra Via Sistina e Via Gregoriana, che include oltre al cinquecentesco Palazzo Zuccari, l'edificio della biblioteca realizzato nel 1962 all'interno dell'originario giardino della residenza-atelier dell'architetto manierista Federico Zuccari.
